Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHAP40939 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHAP40939 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHAP40939 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHAP40939 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHAP40939 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHAP40939 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHAP40939 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHAP40939 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHAP40939 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHAP40939 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHAP40939 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHAP40939 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHAP40939 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHAP40939 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHAP40939 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHAP40939 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHAP40939 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHAP40939 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHAP40939 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHAP40939 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHAP40939 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHAP40939 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHAP40939 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHAP40939 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHAP40939 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHAP40939 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHAP40939 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHAP40939 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHAP40939 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHAP40939 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHAP40939 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHAP40939 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHAP40939 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHAP40939 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HADHAP40939 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HADHAP40939 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHAP40939 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHAP40939 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHAP40939 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHAP40939 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHAP40939 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHAP40939 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHAP40939 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHAP40939 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHAP40939 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHAP40939 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHAP40939 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHAP40939 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHAP40939 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHAP40939 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHAP40939 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHAP40939 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHAP40939 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHAP40939 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHAP40939 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHAP40939 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHAP40939 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHAP40939 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHAP40939 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms