Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH1P40692 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH1P40692 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH1P40692 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH1P40692 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH1P40692 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH1P40692 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLH1P40692 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH1P40692 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH1P40692 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH1P40692 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH1P40692 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH1P40692 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH1P40692 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH1P40692 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH1P40692 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH1P40692 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH1P40692 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH1P40692 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH1P40692 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH1P40692 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH1P40692 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH1P40692 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH1P40692 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH1P40692 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH1P40692 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH1P40692 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH1P40692 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH1P40692 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH1P40692 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH1P40692 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLH1P40692 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLH1P40692 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH1P40692 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH1P40692 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH1P40692 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH1P40692 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH1P40692 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MLH1P40692 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLH1P40692 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH1P40692 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLH1P40692 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLH1P40692 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MLH1P40692 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MLH1P40692 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MLH1P40692 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MLH1P40692 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MLH1P40692 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MLH1P40692 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MLH1P40692 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MLH1P40692 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MLH1P40692 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MLH1P40692 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MLH1P40692 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MLH1P40692 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MLH1P40692 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLH1P40692 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MLH1P40692 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MLH1P40692 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MLH1P40692 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MLH1P40692 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MLH1P40692 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MLH1P40692 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MLH1P40692 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms