Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR1P36897 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms