Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCLP35914 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLP35914 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms