Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX11P35716 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX11P35716 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX11P35716 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX11P35716 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX11P35716 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX11P35716 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX11P35716 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX11P35716 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX11P35716 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX11P35716 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX11P35716 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX11P35716 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX11P35716 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX11P35716 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX11P35716 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX11P35716 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX11P35716 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX11P35716 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX11P35716 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX11P35716 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX11P35716 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX11P35716 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX11P35716 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX11P35716 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX11P35716 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX11P35716 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX11P35716 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX11P35716 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX11P35716 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX11P35716 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX11P35716 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX11P35716 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX11P35716 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX11P35716 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX11P35716 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX11P35716 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX11P35716 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX11P35716 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX11P35716 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX11P35716 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX11P35716 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX11P35716 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX11P35716 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX11P35716 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX11P35716 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX11P35716 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX11P35716 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX11P35716 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX11P35716 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX11P35716 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX11P35716 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX11P35716 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX11P35716 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX11P35716 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX11P35716 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX11P35716 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX11P35716 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms