Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-10■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 TAOK1-206ENST00000587277 353 ntTSL 26.11□□□□□ -1.433e-10■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-12■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 521.66■■□□□ 1.069e-10■■■■■ 46
GTF2F1P35269 AP2A2-217ENST00000529818 549 ntTSL 411.98□□□□□ -0.499e-10■■■■■ 46
GTF2F1P35269 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.966e-9■■■■■ 46
GTF2F1P35269 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 419.19■□□□□ 0.666e-9■■■■■ 46
GTF2F1P35269 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 06e-9■■■■■ 46
GTF2F1P35269 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.256e-9■■■■■ 46
GTF2F1P35269 IQSEC1-203ENST00000474467 436 ntTSL 38.97□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 46
GTF2F1P35269 AC008760.2-201ENST00000614781 1357 ntBASIC12.2□□□□□ -0.464e-11■■■■■ 45.9
GTF2F1P35269 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.787e-8■■■■■ 45.9
GTF2F1P35269 ERMARD-201ENST00000366771 2206 ntTSL 215.4■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 45.9
GTF2F1P35269 ERMARD-204ENST00000392095 1908 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 45.9
GTF2F1P35269 ERMARD-203ENST00000366773 2141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.567e-8■■■■■ 45.9
GTF2F1P35269 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.897e-8■■■■■ 45.9
GTF2F1P35269 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.117e-8■■■■■ 45.9
GTF2F1P35269 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 416.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 416.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 216.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.44e-22■■■■■ 45.8
GTF2F1P35269 ACSF3-207ENST00000537155 848 ntTSL 215.18■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 45.7
GTF2F1P35269 ACSF3-205ENST00000535176 421 ntTSL 311.24□□□□□ -0.619e-7■■■■■ 45.7
GTF2F1P35269 ZNF444-212ENST00000593100 562 ntTSL 223.15■■□□□ 1.37e-9■■■■■ 45.7
GTF2F1P35269 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 45.7
GTF2F1P35269 ANKRD20A5P-205ENST00000581181 1180 ntTSL 325.88■■□□□ 1.737e-12■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.457e-12■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 ANKRD20A5P-206ENST00000581363 582 ntTSL 314.03□□□□□ -0.167e-12■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 ABCA2-207ENST00000437791 697 ntTSL 521.08■□□□□ 0.971e-9■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 228.96■■■□□ 2.233e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.873e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.837e-10■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.833e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.73e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.483e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 222.21■■□□□ 1.157e-10■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 KLHL18-202ENST00000433449 560 ntTSL 420.99■□□□□ 0.953e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 KLHL18-203ENST00000437353 463 ntTSL 220.02■□□□□ 0.83e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 KLHL18-206ENST00000483201 375 ntTSL 1 (best)19.06■□□□□ 0.643e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 517.76■□□□□ 0.437e-10■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.357e-10■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 215.31■□□□□ 0.047e-10■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 KLHL18-204ENST00000442272 2249 ntTSL 215.11■□□□□ 0.013e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 ZBTB22-209ENST00000441117 581 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 KLHL18-205ENST00000461084 3206 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.523e-11■■■■■ 45.5
GTF2F1P35269 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.733e-18■■■■■ 45.4
GTF2F1P35269 ST6GAL1-212ENST00000448408 1005 ntTSL 510.88□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 45.3
GTF2F1P35269 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.642e-7■■■■■ 45.2
GTF2F1P35269 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)21.9■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 45.2
GTF2F1P35269 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 321.08■□□□□ 0.973e-24■■■■■ 45.2
GTF2F1P35269 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 518.35■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.416e-8■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 511.41□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.23e-10■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-10■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 SQLE-205ENST00000521232 711 ntTSL 318.96■□□□□ 0.633e-10■■■■■ 45.1
GTF2F1P35269 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 45
GTF2F1P35269 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 45
GTF2F1P35269 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 48.79□□□□□ -18e-14■■■■■ 44.9
GTF2F1P35269 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.429e-7■■■■■ 44.8
GTF2F1P35269 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.342e-12■■■■■ 44.8
GTF2F1P35269 R3HDM4-202ENST00000586080 537 ntTSL 423.82■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 318.51■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 517.88■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 CPNE7-208ENST00000566398 672 ntTSL 321.03■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-203ENST00000501869 684 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-221ENST00000568366 767 ntTSL 419.17■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-205ENST00000504769 548 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-206ENST00000504922 585 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-210ENST00000510087 590 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-213ENST00000483020 563 ntTSL 415.1■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TSC2-212ENST00000471143 577 ntTSL 413.36□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-201ENST00000496733 409 ntTSL 39.04□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 TMEM161B-AS1-211ENST00000512724 570 ntTSL 35.48□□□□□ -1.531e-8■■■■■ 44.7
GTF2F1P35269 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 533.97■■■■□ 3.036e-8■■■■■ 44.6
GTF2F1P35269 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 418.01■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 44.6
GTF2F1P35269 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 44.5
GTF2F1P35269 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.681e-10■■■■■ 44.5
GTF2F1P35269 CEP72-204ENST00000514507 897 ntTSL 315.21■□□□□ 0.033e-12■■■■■ 44.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 295 ms