Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2H1P32780 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2H1P32780 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms