Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC8A1P32418 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A1P32418 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms