Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB5P28074 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMB5P28074 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB5P28074 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms