Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB4P28070 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB4P28070 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMB4P28070 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB4P28070 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms