Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU1F1P28069 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POU1F1P28069 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU1F1P28069 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms