Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARNTP27540 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARNTP27540 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARNTP27540 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARNTP27540 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARNTP27540 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARNTP27540 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARNTP27540 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARNTP27540 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARNTP27540 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARNTP27540 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARNTP27540 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARNTP27540 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARNTP27540 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARNTP27540 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARNTP27540 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARNTP27540 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARNTP27540 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARNTP27540 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARNTP27540 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARNTP27540 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARNTP27540 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARNTP27540 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARNTP27540 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARNTP27540 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTP27540 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTP27540 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTP27540 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTP27540 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTP27540 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTP27540 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTP27540 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTP27540 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTP27540 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTP27540 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARNTP27540 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARNTP27540 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTP27540 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTP27540 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTP27540 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTP27540 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTP27540 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTP27540 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTP27540 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTP27540 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTP27540 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTP27540 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTP27540 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTP27540 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTP27540 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTP27540 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTP27540 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTP27540 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTP27540 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTP27540 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTP27540 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTP27540 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTP27540 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTP27540 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTP27540 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTP27540 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTP27540 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTP27540 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTP27540 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTP27540 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms