Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMLP26374 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMLP26374 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMLP26374 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMLP26374 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMLP26374 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMLP26374 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMLP26374 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMLP26374 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMLP26374 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMLP26374 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMLP26374 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMLP26374 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMLP26374 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMLP26374 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMLP26374 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMLP26374 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMLP26374 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMLP26374 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMLP26374 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMLP26374 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMLP26374 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMLP26374 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMLP26374 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMLP26374 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMLP26374 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMLP26374 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMLP26374 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMLP26374 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMLP26374 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMLP26374 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMLP26374 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMLP26374 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMLP26374 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMLP26374 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMLP26374 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMLP26374 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMLP26374 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMLP26374 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMLP26374 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMLP26374 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMLP26374 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMLP26374 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMLP26374 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMLP26374 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMLP26374 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMLP26374 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMLP26374 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMLP26374 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHMLP26374 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHMLP26374 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMLP26374 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMLP26374 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMLP26374 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMLP26374 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMLP26374 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMLP26374 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMLP26374 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMLP26374 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMLP26374 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMLP26374 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMLP26374 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMLP26374 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMLP26374 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMLP26374 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMLP26374 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMLP26374 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMLP26374 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMLP26374 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMLP26374 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMLP26374 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CHMLP26374 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMLP26374 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMLP26374 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMLP26374 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMLP26374 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMLP26374 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMLP26374 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMLP26374 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMLP26374 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMLP26374 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMLP26374 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMLP26374 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMLP26374 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms