Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA2P26232 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA2P26232 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNA2P26232 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms