Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA1P23193 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCEA1P23193 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCEA1P23193 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms