Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A1P22736 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR4A1P22736 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms