Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME2P22392 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME2P22392 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P22392 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P22392 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P22392 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P22392 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P22392 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P22392 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P22392 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P22392 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P22392 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P22392 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME2P22392 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME2P22392 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME2P22392 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P22392 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P22392 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P22392 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P22392 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P22392 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P22392 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P22392 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P22392 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P22392 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P22392 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P22392 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P22392 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P22392 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P22392 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P22392 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P22392 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P22392 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P22392 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P22392 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P22392 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P22392 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P22392 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P22392 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P22392 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P22392 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P22392 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P22392 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P22392 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P22392 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P22392 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P22392 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P22392 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P22392 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P22392 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P22392 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P22392 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P22392 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P22392 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P22392 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P22392 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P22392 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P22392 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P22392 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P22392 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P22392 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P22392 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P22392 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P22392 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms