Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP3P21580 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFAIP3P21580 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP3P21580 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP3P21580 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms