Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A1P19634 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A1P19634 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A1P19634 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.8 ms