Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCC1P18754 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCC1P18754 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCC1P18754 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCC1P18754 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCC1P18754 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCC1P18754 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCC1P18754 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCC1P18754 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCC1P18754 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCC1P18754 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCC1P18754 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCC1P18754 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCC1P18754 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCC1P18754 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCC1P18754 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCC1P18754 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCC1P18754 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCC1P18754 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCC1P18754 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCC1P18754 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCC1P18754 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCC1P18754 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCC1P18754 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCC1P18754 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCC1P18754 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCC1P18754 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCC1P18754 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCC1P18754 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCC1P18754 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCC1P18754 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCC1P18754 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCC1P18754 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCC1P18754 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCC1P18754 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RCC1P18754 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RCC1P18754 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms