Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB3P14651 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB3P14651 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB3P14651 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB3P14651 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 466.6 ms