Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RLBP1P12271 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RLBP1P12271 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RLBP1P12271 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms