Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RD3LP0DJH9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RD3LP0DJH9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms