Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MGPP08493 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MGPP08493 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MGPP08493 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MGPP08493 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MGPP08493 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MGPP08493 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MGPP08493 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MGPP08493 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MGPP08493 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MGPP08493 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MGPP08493 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MGPP08493 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MGPP08493 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MGPP08493 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MGPP08493 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MGPP08493 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MGPP08493 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MGPP08493 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MGPP08493 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MGPP08493 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MGPP08493 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MGPP08493 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MGPP08493 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MGPP08493 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MGPP08493 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MGPP08493 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MGPP08493 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MGPP08493 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MGPP08493 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MGPP08493 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MGPP08493 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MGPP08493 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MGPP08493 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MGPP08493 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MGPP08493 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MGPP08493 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms