Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCCBP05166 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCBP05166 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCBP05166 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCBP05166 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCBP05166 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCBP05166 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCBP05166 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCBP05166 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCBP05166 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCBP05166 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCBP05166 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCBP05166 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCBP05166 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCCBP05166 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCBP05166 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCBP05166 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCBP05166 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCBP05166 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCBP05166 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCBP05166 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCBP05166 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCBP05166 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCBP05166 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCBP05166 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCBP05166 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCBP05166 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCBP05166 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCBP05166 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCBP05166 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCBP05166 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCBP05166 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCBP05166 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCBP05166 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCCBP05166 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCBP05166 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCBP05166 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCBP05166 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCBP05166 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCBP05166 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCBP05166 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCBP05166 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCBP05166 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCBP05166 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCBP05166 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCBP05166 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCBP05166 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCBP05166 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCBP05166 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCBP05166 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCBP05166 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms