Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX3O95343 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX3O95343 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX3O95343 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX3O95343 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIX3O95343 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX3O95343 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX3O95343 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX3O95343 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX3O95343 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX3O95343 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX3O95343 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX3O95343 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX3O95343 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX3O95343 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX3O95343 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX3O95343 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX3O95343 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX3O95343 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX3O95343 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX3O95343 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX3O95343 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX3O95343 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX3O95343 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX3O95343 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX3O95343 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX3O95343 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX3O95343 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX3O95343 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX3O95343 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX3O95343 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX3O95343 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX3O95343 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX3O95343 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX3O95343 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX3O95343 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX3O95343 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX3O95343 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX3O95343 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX3O95343 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX3O95343 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX3O95343 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX3O95343 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX3O95343 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX3O95343 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX3O95343 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX3O95343 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX3O95343 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX3O95343 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX3O95343 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX3O95343 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX3O95343 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX3O95343 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX3O95343 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX3O95343 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX3O95343 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX3O95343 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX3O95343 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX3O95343 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX3O95343 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX3O95343 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX3O95343 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX3O95343 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX3O95343 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX3O95343 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX3O95343 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX3O95343 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX3O95343 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX3O95343 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX3O95343 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX3O95343 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX3O95343 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX3O95343 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX3O95343 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX3O95343 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX3O95343 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX3O95343 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX3O95343 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX3O95343 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX3O95343 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX3O95343 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms