Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX4O95219 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX4O95219 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX4O95219 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX4O95219 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX4O95219 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX4O95219 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX4O95219 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX4O95219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX4O95219 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX4O95219 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX4O95219 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX4O95219 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX4O95219 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX4O95219 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX4O95219 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX4O95219 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX4O95219 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX4O95219 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX4O95219 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX4O95219 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX4O95219 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX4O95219 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX4O95219 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX4O95219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX4O95219 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX4O95219 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX4O95219 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX4O95219 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX4O95219 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX4O95219 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX4O95219 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX4O95219 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX4O95219 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX4O95219 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX4O95219 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX4O95219 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX4O95219 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX4O95219 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX4O95219 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX4O95219 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX4O95219 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX4O95219 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX4O95219 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX4O95219 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX4O95219 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX4O95219 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX4O95219 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX4O95219 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX4O95219 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX4O95219 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms