Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC4O75487 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC4O75487 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC4O75487 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC4O75487 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC4O75487 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC4O75487 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC4O75487 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC4O75487 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC4O75487 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC4O75487 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC4O75487 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC4O75487 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC4O75487 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC4O75487 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC4O75487 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC4O75487 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC4O75487 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC4O75487 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC4O75487 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC4O75487 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC4O75487 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC4O75487 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC4O75487 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC4O75487 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC4O75487 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC4O75487 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC4O75487 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC4O75487 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC4O75487 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC4O75487 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC4O75487 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC4O75487 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC4O75487 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC4O75487 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC4O75487 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC4O75487 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC4O75487 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC4O75487 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC4O75487 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC4O75487 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC4O75487 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC4O75487 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC4O75487 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC4O75487 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC4O75487 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC4O75487 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC4O75487 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC4O75487 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC4O75487 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC4O75487 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC4O75487 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC4O75487 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC4O75487 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC4O75487 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC4O75487 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC4O75487 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC4O75487 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC4O75487 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC4O75487 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC4O75487 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC4O75487 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC4O75487 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC4O75487 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC4O75487 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC4O75487 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC4O75487 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC4O75487 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC4O75487 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC4O75487 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC4O75487 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC4O75487 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC4O75487 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC4O75487 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC4O75487 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC4O75487 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC4O75487 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC4O75487 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC4O75487 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC4O75487 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC4O75487 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC4O75487 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC4O75487 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC4O75487 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC4O75487 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC4O75487 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC4O75487 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC4O75487 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms