Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS26AO75436 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS26AO75436 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS26AO75436 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS26AO75436 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS26AO75436 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms