Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH4O75427 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH4O75427 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms