Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRMT3O60678 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRMT3O60678 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT3O60678 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT3O60678 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms