Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL41O60662 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL41O60662 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL41O60662 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms