Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP3LO60238 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BNIP3LO60238 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms