Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP9O43818 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP9O43818 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP9O43818 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP9O43818 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP9O43818 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP9O43818 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP9O43818 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP9O43818 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP9O43818 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP9O43818 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP9O43818 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP9O43818 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP9O43818 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP9O43818 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP9O43818 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP9O43818 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP9O43818 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP9O43818 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP9O43818 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP9O43818 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP9O43818 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP9O43818 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP9O43818 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP9O43818 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP9O43818 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP9O43818 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP9O43818 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP9O43818 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP9O43818 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP9O43818 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP9O43818 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP9O43818 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP9O43818 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP9O43818 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP9O43818 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP9O43818 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP9O43818 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP9O43818 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP9O43818 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP9O43818 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP9O43818 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP9O43818 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP9O43818 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP9O43818 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP9O43818 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP9O43818 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRP9O43818 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP9O43818 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP9O43818 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP9O43818 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP9O43818 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP9O43818 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP9O43818 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP9O43818 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP9O43818 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP9O43818 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP9O43818 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP9O43818 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP9O43818 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP9O43818 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP9O43818 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP9O43818 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP9O43818 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP9O43818 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP9O43818 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP9O43818 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP9O43818 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP9O43818 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP9O43818 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP9O43818 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RRP9O43818 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP9O43818 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP9O43818 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP9O43818 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 471 ms