Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LANCL1O43813 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms