Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCK2O43639 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCK2O43639 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCK2O43639 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCK2O43639 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCK2O43639 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCK2O43639 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCK2O43639 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCK2O43639 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCK2O43639 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCK2O43639 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCK2O43639 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCK2O43639 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCK2O43639 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCK2O43639 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCK2O43639 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCK2O43639 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCK2O43639 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCK2O43639 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCK2O43639 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NCK2O43639 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCK2O43639 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCK2O43639 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCK2O43639 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCK2O43639 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCK2O43639 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCK2O43639 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCK2O43639 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCK2O43639 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCK2O43639 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCK2O43639 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCK2O43639 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCK2O43639 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCK2O43639 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCK2O43639 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCK2O43639 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCK2O43639 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCK2O43639 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCK2O43639 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCK2O43639 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCK2O43639 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NCK2O43639 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCK2O43639 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCK2O43639 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCK2O43639 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCK2O43639 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCK2O43639 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCK2O43639 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCK2O43639 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCK2O43639 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCK2O43639 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCK2O43639 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCK2O43639 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCK2O43639 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCK2O43639 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCK2O43639 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCK2O43639 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCK2O43639 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCK2O43639 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCK2O43639 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCK2O43639 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCK2O43639 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NCK2O43639 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCK2O43639 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCK2O43639 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCK2O43639 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCK2O43639 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCK2O43639 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCK2O43639 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCK2O43639 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCK2O43639 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms