Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBFA2T2O43439 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBFA2T2O43439 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms