Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATMINO43313 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATMINO43313 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATMINO43313 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATMINO43313 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATMINO43313 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATMINO43313 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATMINO43313 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATMINO43313 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATMINO43313 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMINO43313 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMINO43313 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMINO43313 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMINO43313 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMINO43313 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMINO43313 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATMINO43313 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATMINO43313 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATMINO43313 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATMINO43313 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATMINO43313 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMINO43313 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMINO43313 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMINO43313 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMINO43313 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMINO43313 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMINO43313 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMINO43313 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATMINO43313 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATMINO43313 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATMINO43313 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATMINO43313 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATMINO43313 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATMINO43313 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATMINO43313 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATMINO43313 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATMINO43313 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATMINO43313 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATMINO43313 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATMINO43313 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMINO43313 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMINO43313 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMINO43313 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMINO43313 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMINO43313 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATMINO43313 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATMINO43313 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATMINO43313 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATMINO43313 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATMINO43313 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMINO43313 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMINO43313 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMINO43313 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMINO43313 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMINO43313 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMINO43313 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMINO43313 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATMINO43313 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATMINO43313 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATMINO43313 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATMINO43313 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATMINO43313 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATMINO43313 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATMINO43313 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATMINO43313 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATMINO43313 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATMINO43313 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATMINO43313 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATMINO43313 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATMINO43313 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATMINO43313 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATMINO43313 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATMINO43313 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATMINO43313 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATMINO43313 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATMINO43313 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATMINO43313 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATMINO43313 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATMINO43313 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATMINO43313 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATMINO43313 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATMINO43313 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATMINO43313 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATMINO43313 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATMINO43313 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMINO43313 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms