Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTIFO43310 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTIFO43310 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTIFO43310 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTIFO43310 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTIFO43310 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTIFO43310 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTIFO43310 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTIFO43310 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTIFO43310 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTIFO43310 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTIFO43310 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTIFO43310 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTIFO43310 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTIFO43310 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTIFO43310 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTIFO43310 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTIFO43310 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTIFO43310 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTIFO43310 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTIFO43310 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTIFO43310 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTIFO43310 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTIFO43310 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTIFO43310 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CTIFO43310 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTIFO43310 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTIFO43310 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTIFO43310 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTIFO43310 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTIFO43310 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTIFO43310 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTIFO43310 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTIFO43310 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTIFO43310 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTIFO43310 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CTIFO43310 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTIFO43310 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTIFO43310 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTIFO43310 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTIFO43310 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTIFO43310 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTIFO43310 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTIFO43310 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTIFO43310 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTIFO43310 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTIFO43310 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTIFO43310 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTIFO43310 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTIFO43310 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTIFO43310 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTIFO43310 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTIFO43310 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTIFO43310 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTIFO43310 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTIFO43310 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTIFO43310 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTIFO43310 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTIFO43310 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTIFO43310 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTIFO43310 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTIFO43310 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTIFO43310 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTIFO43310 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTIFO43310 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTIFO43310 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTIFO43310 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTIFO43310 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTIFO43310 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTIFO43310 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTIFO43310 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTIFO43310 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTIFO43310 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTIFO43310 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTIFO43310 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTIFO43310 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTIFO43310 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTIFO43310 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTIFO43310 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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