Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP8O43159 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP8O43159 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP8O43159 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP8O43159 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP8O43159 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP8O43159 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP8O43159 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP8O43159 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP8O43159 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP8O43159 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP8O43159 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP8O43159 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP8O43159 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP8O43159 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP8O43159 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP8O43159 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP8O43159 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP8O43159 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP8O43159 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP8O43159 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP8O43159 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP8O43159 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP8O43159 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP8O43159 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP8O43159 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP8O43159 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP8O43159 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP8O43159 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP8O43159 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP8O43159 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP8O43159 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP8O43159 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP8O43159 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP8O43159 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP8O43159 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP8O43159 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP8O43159 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP8O43159 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP8O43159 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP8O43159 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP8O43159 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP8O43159 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP8O43159 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP8O43159 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP8O43159 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP8O43159 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP8O43159 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP8O43159 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP8O43159 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP8O43159 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP8O43159 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP8O43159 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP8O43159 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP8O43159 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP8O43159 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP8O43159 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP8O43159 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP8O43159 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP8O43159 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP8O43159 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP8O43159 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP8O43159 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP8O43159 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP8O43159 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP8O43159 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP8O43159 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP8O43159 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP8O43159 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP8O43159 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP8O43159 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRP8O43159 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRP8O43159 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms