Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZZEF1O43149 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZZEF1O43149 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
ZZEF1O43149 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZZEF1O43149 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms