Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSC2O15499 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSC2O15499 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSC2O15499 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSC2O15499 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSC2O15499 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSC2O15499 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSC2O15499 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSC2O15499 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSC2O15499 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSC2O15499 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSC2O15499 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSC2O15499 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSC2O15499 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSC2O15499 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSC2O15499 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSC2O15499 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSC2O15499 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSC2O15499 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSC2O15499 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSC2O15499 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSC2O15499 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSC2O15499 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSC2O15499 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSC2O15499 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GSC2O15499 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSC2O15499 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSC2O15499 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSC2O15499 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSC2O15499 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSC2O15499 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSC2O15499 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSC2O15499 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSC2O15499 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSC2O15499 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSC2O15499 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSC2O15499 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSC2O15499 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSC2O15499 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSC2O15499 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSC2O15499 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSC2O15499 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSC2O15499 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSC2O15499 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSC2O15499 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSC2O15499 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSC2O15499 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSC2O15499 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSC2O15499 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSC2O15499 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSC2O15499 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSC2O15499 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSC2O15499 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSC2O15499 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSC2O15499 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSC2O15499 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSC2O15499 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSC2O15499 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSC2O15499 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSC2O15499 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSC2O15499 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSC2O15499 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSC2O15499 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms