Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHUKO15111 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHUKO15111 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHUKO15111 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHUKO15111 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHUKO15111 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHUKO15111 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHUKO15111 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHUKO15111 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHUKO15111 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHUKO15111 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHUKO15111 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHUKO15111 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHUKO15111 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHUKO15111 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHUKO15111 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHUKO15111 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHUKO15111 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHUKO15111 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHUKO15111 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHUKO15111 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHUKO15111 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHUKO15111 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHUKO15111 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHUKO15111 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHUKO15111 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHUKO15111 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHUKO15111 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHUKO15111 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHUKO15111 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHUKO15111 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHUKO15111 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHUKO15111 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHUKO15111 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHUKO15111 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHUKO15111 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHUKO15111 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHUKO15111 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHUKO15111 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHUKO15111 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHUKO15111 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHUKO15111 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHUKO15111 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHUKO15111 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHUKO15111 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHUKO15111 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHUKO15111 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHUKO15111 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHUKO15111 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHUKO15111 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHUKO15111 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHUKO15111 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHUKO15111 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHUKO15111 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHUKO15111 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHUKO15111 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHUKO15111 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHUKO15111 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHUKO15111 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHUKO15111 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHUKO15111 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHUKO15111 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHUKO15111 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHUKO15111 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHUKO15111 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHUKO15111 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHUKO15111 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms