Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLGNO14967 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLGNO14967 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLGNO14967 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLGNO14967 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLGNO14967 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLGNO14967 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLGNO14967 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLGNO14967 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLGNO14967 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLGNO14967 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLGNO14967 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLGNO14967 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLGNO14967 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLGNO14967 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLGNO14967 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLGNO14967 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLGNO14967 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLGNO14967 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLGNO14967 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLGNO14967 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLGNO14967 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLGNO14967 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLGNO14967 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLGNO14967 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLGNO14967 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLGNO14967 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLGNO14967 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLGNO14967 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLGNO14967 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLGNO14967 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLGNO14967 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLGNO14967 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLGNO14967 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLGNO14967 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLGNO14967 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLGNO14967 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLGNO14967 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLGNO14967 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLGNO14967 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLGNO14967 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLGNO14967 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLGNO14967 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLGNO14967 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLGNO14967 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLGNO14967 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLGNO14967 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLGNO14967 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLGNO14967 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLGNO14967 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLGNO14967 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLGNO14967 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLGNO14967 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLGNO14967 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLGNO14967 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLGNO14967 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLGNO14967 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLGNO14967 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLGNO14967 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLGNO14967 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms