Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKO14936 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKO14936 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKO14936 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKO14936 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKO14936 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKO14936 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASKO14936 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKO14936 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKO14936 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKO14936 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKO14936 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKO14936 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKO14936 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKO14936 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASKO14936 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKO14936 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKO14936 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKO14936 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKO14936 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKO14936 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKO14936 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKO14936 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKO14936 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKO14936 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKO14936 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKO14936 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKO14936 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKO14936 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKO14936 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKO14936 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKO14936 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKO14936 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKO14936 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKO14936 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKO14936 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKO14936 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKO14936 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKO14936 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKO14936 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKO14936 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKO14936 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKO14936 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKO14936 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKO14936 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASKO14936 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASKO14936 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKO14936 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKO14936 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKO14936 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKO14936 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKO14936 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKO14936 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKO14936 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKO14936 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKO14936 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKO14936 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKO14936 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKO14936 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKO14936 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKO14936 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKO14936 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKO14936 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKO14936 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKO14936 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKO14936 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms