Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN7AO14910 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN7AO14910 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN7AO14910 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms