Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN6O00399 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN6O00399 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN6O00399 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms