Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYO1FO00160 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1FO00160 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1FO00160 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms