Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QLW9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QLW9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QLW9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QLW9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QLW9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QLW9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QLW9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QLW9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QLW9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QLW9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QLW9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QLW9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QLW9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QLW9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QLW9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QLW9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QLW9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QLW9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
J3QLW9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QLW9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QLW9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QLW9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QLW9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QLW9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QLW9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QLW9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QLW9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QLW9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QLW9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QLW9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QLW9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QLW9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QLW9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QLW9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QLW9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QLW9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QLW9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QLW9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QLW9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QLW9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QLW9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QLW9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QLW9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QLW9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QLW9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QLW9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QLW9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QLW9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QLW9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QLW9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QLW9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms