Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KTA2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KTA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KTA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KTA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KTA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KTA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KTA2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KTA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KTA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KTA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KTA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KTA2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KTA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KTA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KTA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KTA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KTA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KTA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KTA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KTA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KTA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KTA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KTA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KTA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KTA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KTA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KTA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KTA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KTA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KTA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KTA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KTA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KTA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
J3KTA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3KTA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3KTA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
J3KTA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KTA2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KTA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KTA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KTA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KTA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KTA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KTA2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KTA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KTA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KTA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KTA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KTA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KTA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KTA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms